乾隆三十三年，平静了几十年的闽海突起波澜。这年十月，台湾突发以黄教为首的游民暴乱。

黄教原籍同安，后迁居台湾大目降（今台南市新化区）山区。黄教平日游手好闲，曾代人看管稻田，又曾因偷牛被捉。后来贫纠众偷窃，被乡间盗牛贼奉为首领，他与养牛人家约定，一头牛一年缴纳粟一石，才能保牛之平安，亡命之徒多归附于他，纯粹一黑恶团伙势力。有个名叫黄弼的人，与黄教交恶，黄教手下就割去黄弼的耳鼻。黄弼投诉官府，知县派差役捉拿，差役又被砍去手指放回来报信。知府闻讯大惊，下令地方严拿，于是差役四出。黄教干脆率众人举旗起事，杀兵丁，焚军营，抢军器，攻占了凤山县冈山汛。台湾镇总兵派兵征剿，黄教一伙逃往内山，而且还四出劫掠，与官军玩起游击战来。一时间凤山、诸罗各县为之震动。台湾镇总兵见势头不对，才将情报传回大陆。闽省紧急部署，水师提督吴必达率兵渡台，巡抚鄂宁驻厦接济。一个多月内，黄教党徒三百余人已陆续杀害千总、把总各1名，兵丁73名；焚毁营房6处；抢走军器若干。

泉州提督府古城墙  

此时乾隆帝一门心思全在征伐缅甸之上。与西南用事相比，台湾的黄教也就是“么髍小窃”，实在“不成事体”。但是二个月下来，乾隆再接到的报告，依然还是“贼众东窃西扰，官兵疲于奔走，未易克期竣事”。不禁大为恼怒，责怪水师提督吴必达“平日尚属能事，昨一闻逆匪蔓延之信，即带兵渡海督办，颇觉勇往。何以甫至台湾，辄尔张皇顾虑？纵使避匿山洞，官兵奋力合剿，何难克期就获。”命令吴必达紧急督兵，设法搜剿，迅速擒获，以靖海疆。

此时的西南征缅用兵正计划水陆并进，乾隆认为“闽省水师，最为精练”，因此下令闽省派兵二千名，前往滇省。乾隆相中了新任台湾总兵的叶相德，令其在水师中挑选“素娴水面操驾攻击，及能伏水潜取贼船”的人才，往赴云南。而台湾总兵军务由水师提督吴必达兼管。

叶相德还未出发，乾隆又嫌他慢，发怒了，下诏训斥吴必达：“贼匪仅二三百人，而前后所调官兵，多至数十倍，你一至台湾，竟安坐郡城，并不亲往剿贼，迁延时日，至今毫无措置”。失望之余，乾隆爽性将吴必达给撤职了，所有剿捕贼匪之事，交给叶相德专办。而其赴云南军务，等剿擒黄教后再办。

就在乾隆为台湾事发怒发愁的当口，台湾官军从一月开始组织兵力搜剿内山。三月初，黄教被官军收买的叛徒砍伤后逃遁。乾隆帝见报，还是不爽，又训斥道：“黄教么髍贼匪，竟要官兵剿捕数月，听其东西奔窜。台湾如此局势，皆由文武各员散漫因循，耽延时日，致凶渠久稽显戮。尚复成何事体！”总之，黄教一日不获，此案一日不了。他担心不斩草除根，将来“或复煽聚滋事”。怠慢的福建官员此时将皇帝老子彻底惹恼了。

三月底，潜匿在山间的黄教终被官军围剿被擒，抬回军营又伤重不治身死。官府将黄教尸身碎剐，将砍下的手足，分发于犯事各地方悬挂示众。总督崔应阶在向乾隆报告战果的同时，也趁机为属下请功说项，但乾隆却是铁了心，又一道圣旨：“吴必达即着革职，令其自备资斧往云南效力”。

他余怒未息，又把福建的一干官员也给办了。

甘国宝奏折  

到了年底，战事稍缓，乾隆皇帝的脾气已过，开始想念老臣了，想起当年甘国宝在福建水师提督任上军纪严谨、士气高昂的情形，觉得福建治军，还需这名老将，于是降旨：调补甘国宝福建全省陆路提督。同时任命他“兼闽阅操大臣”。在清代，专门负责阅兵的官职称作“专操大臣”。专操大臣的工作就是操练阅兵式上的方方面面，以保证在政要阅兵的时候不会出现差错。